医院有临床、医疗、医技科室46个，其中内科消化专业、内科血液专业、临床检验、妇产科、神经内科是省级重点专科；心血管内科、心血管外科、神经内科、神经外科、眼科学是特色专科。年门诊量76余万人次，收住院2.13万人次，中西医结合博士后流动站临床部设在我院。神经内科学专业是省内唯一具有“燕赵学者特聘岗位”的医学专业。内科、外科、神经内科中西医结合临床4个学科17个专业具有博士学位授予权、20个学科28个专业具有硕士学位授予权。河北省心脑血管病研究所、河北省消化病研究所河北省临床检验中心、河北省眼病防治研究中心、河北省血液病研究所、河北省医学情报信息与药品不良反应检察中心、国际医学网络河北医疗保健急救中心、河北省肝胆疾病治疗研究中心、国家卫生部临床药理基地等十余个科研机构设在该院。“科技兴医、科技兴院”装饰一新的科研楼于1998年7月1日竣工，内设28个科研机构、实验室及信息中心、河北省首家“中国公众多媒体通讯网”河北网网上医疗INTERNET网站。

医院许多专业跨入国际、国内先进行列。神经内科“格林-巴利课题组”在该领域的研究取得突破性进展，引起国际学术界广泛关注，并获国家科技进步二等奖，填补了该领域国家级奖项空白；眼科“眼底荧光造研究”获国家卫生部科技进步一等奖；神经外科成功的开展显微镜下大脑深部动、静脉畸形切除术等国内领先技术；1998年5月22日河北省首例试管婴儿在生殖医学中心诞生。近年来，医院共获国家科技进步二等奖1项、部省级科研成果58项、厅级171项。在国家级学术刊物发表论文2240篇、省级3633篇，国际、国内专业学术会议交流论文3223篇，主编医学著作90余部。参编130部；培养博士生、硕士研究生274人。

医院与美国霍普金斯大学医学院、日本信州大学、日本松本齿科大学、刚果埃格利玛医院等建立了长期友好关系，曾接待过美、英、日、法、德、爱尔兰、以色列等十余个国家和地区的医学代表团276余人次来访，出国研修、考察及参加国际会议交流205人次，聘请外籍名誉教授14人。

以人为本开拓，科技铸就辉煌。河北医科大学第二医院将以优秀的人才队伍、特色的专科优势、精湛的医疗技术、精良的医疗设备、良好的医德医风、独特的管理方式，服务人民，奉献社会。

该院在《2007全国医院排名》中神经内科排名名列第六